网上VMD安装教程很多,也非常简单,在这里我只是为了给自己做一下笔记记录一下。

软件下载地址:点我下载

我选择的版本为:LINUX_64 OpenGL, CUDA, TachyonL-OptiX

下载后我放在了

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/home/kangsgo/mdinstall/plot/ 文件夹下

解压文件

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tar -xvf vmd-1.9.2.bin.LINUXAMD64-RHEL5.opengl.tar.gz
cd vmd-1.9.2

修改编译脚本:

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gedit configure

修改两行变为:

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# Directory where VMD startup script is installed, should be in users’ paths.
$install_bin_dir=”/home/kangsgo/mdinstall/plot/vmd-1.9.2/bin”;

→修改成刚刚解压的文件夹中bin的目录;

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2
# Directory where VMD files and executables are installed
$install_library_dir=”/home/kangsgo/mdinstall/plot/vmd-1.9.2/lib/$install_name”;

→修改成刚刚解压的文件夹中lib的目录;
编译设置:

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./configure LINUXAMD64

尾缀意义不详

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cd src
make install

在zshrc中添加一行(具体添加方法查看以前文章)

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# vmd
export PATH=”$PATH:/home/kangsgo/mdinstall/plot/vmd-1.9.2/bin/:.”

参考文献:VMD-LINUX64安装教程