最近遇到了两次需要初略估计蛋白长宽高的情况,其实这个非常简单,在pdb中查看卡迪尔坐标然后排序即可。这里和大家分享三种方法:
1.shell进行读取
这个我之前其实有分享过,代码简单如下:
2.利用python脚本进行读取计算
这个是我今天写的,写的很初略,因为我发现第三种方法最直接简练:
3.Pymol进行读取计算
其实简单的方便的方法可以使用Pymol的get_extent
来获得XYZ的最大最小值,如下排列:
可以使用命令行如下:
PYMOL API如下:
最近遇到了两次需要初略估计蛋白长宽高的情况,其实这个非常简单,在pdb中查看卡迪尔坐标然后排序即可。这里和大家分享三种方法:
这个我之前其实有分享过,代码简单如下:
这个是我今天写的,写的很初略,因为我发现第三种方法最直接简练:
其实简单的方便的方法可以使用Pymol的get_extent
来获得XYZ的最大最小值,如下排列:
可以使用命令行如下:
PYMOL API如下: