感谢厦大-Ares 提供这么好的工具信息
官方安装地址:点我查看
可以看出ubuntu的安装最简单的方式如下:
apt-get install r-base-core netcdf-bin libnetcdf-dev libxml2-dev \
libcurl3-dev seaview muscle pymol
但是ubuntu的R编译包为3.0.2,bio3D要求为3.1+ 所以R需要自己编译
R语言包在这里下载点我下载
R语言安装方法:
tar xzf R-3.2.5.tar.gz
cd R-3.2.5
mkdir -p /home/kangsgo/mdinstall/R
./configure –prefix=/home/kangsgo/mdinstall/R –enable-R-shlib
make
make check
make install
具体的官方安装方法可以:点我查看
环境变量设置:
vim ~/.bash_profile #添加到PATH中: PATH=/home/work/R/bin:$PATH
source ~/.bash_profile #直接运行R命令(大写)
bio3D 安装办法:进入R:
install.packages(“bio3d”, dependencies=TRUE)
q()