MechStiff对于机械刚度计算
MechStiff计算机械阻力对于外力（单轴拉伸）应用在于氨基酸残基3D结构的特殊部分（自己也不是很了解这个，翻译质量较差，建议度原文）
功能
MechStiff使用作为输入已知的结构模型ANM。其能够常常被计算机械刚度/强度图，作为残基的功能指标，和效率刚度（effective stiffness）（或力常量）for each residue averaged over all pairs it forms。分别绘制2D（map）或者1D（profile），残基的强度伴随ribbon的颜色编码来表示（TCL脚本直接通过VMD加载）。绘图和可视化可以用来：
- 鉴定结构外部扰动通过异向性响应
- 测定弱或强相互作用的双根据外力受到扰动(拉伸)的方向和位点
- 测定宏观的有效弹性系数，通过比较数据，这些数据来自Single Molecule Force Spectroscopy (SMFS) 或atomic force microscopy (AFM)
- 计算每个模型的贡献对于变形比对选择的变形
参考文献
Eyal E, Bahar I Toward a Molecular Understanding of the Anisotropic Response of Proteins to External Forces: Insights from Elastic Network Models Biophys J 2008 94(9):3424-3435.
