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SmartDraw是世界上最流行的商业绘图软件。2006 年获美国政府司法部 (U.S. Department of Justice) 专用软件，2007获美国政府商务部 (US Department of Commence)选用。 ——摘自百度百科，软件待研究 Continue reading...

今天在科研动力看到一篇关于初步选题的文章，正好最近在找选题思路，所以就理一理，把内容结合自己的实际情况来做一遍，有兴趣的同学可以看文章原文： 主要讲的内容为如何利用 PubReMiner 进行科研选题。 粗略搜索 首先要根据导师的意愿在 PubMed 中进行粗略的搜索。 我的导师主要是想要我做分子模拟和实验相结合的内容，由于师兄主要从事芳香烃受体方面，分子模拟主要能够做突变以及和配体结合性的... Continue reading...

nstxout = 0 ; save coordinates every 2 psnstvout = 0 ; save velocities every 2 ps4.6.x 使用-b -e -dt 来控制指定帧数 例：1trjconv_mpi -f mdwholeNOjump.xtc -s 1stframe.pdb -b 49000 -e 50000 -dt 100 -n index.ndx... Continue reading...

原文标题：In Silico Analysis of the Interaction of Avian Aryl Hydrocarbon Receptors and Dioxins to Decipher Isoform‑, Ligand‑, and Species-Specific Activations 影响因子：5.4 摘要：AhR调节有毒的TCDD和其他的二恶英类似物（DLCs）的应... Continue reading...

首先下载2015年的sci的Excel，IF-2015 打开后选择影响因子大于你想要的影响因子（这里我们选择的大于5）的标题，如下图： 捕获 选择性粘贴进入word中 ... Continue reading...

Epock是一个可以动态计算结合腔大小的一个软件，由于有VMD的可视化软件，所以非常的容易上手，简单~ 官网地址：点我查看 翻译文档：点我下载 Continue reading...

1.保存图片： File->;Render->;Start Rendering Continue reading...

由于我EVO跑了50ns并未平衡，所以还需要继续加跑时间查看，在网上查了一些续跑的资料，现在续跑分享给大家～ 1.重启模拟（未测试） 适用范围，突然停机等等，有检查点生成的 1mdrun -s md_0_1.tpr -cpi state.cpt –append _(不能改变核数) 以上 state.cpt 文件为最新生产的断点文件（ mdrun 会保存另外一个断点文件：_stateprev.... Continue reading...

由于自己在使用G_mmbps时发现并不是那么准确,反复计算均未得到自己想要的结果,所以想试一下GMXPBSAtool得到的结果,但是安装和调试bug就花费了我一上午的时间,为了帮助大家更加快速的使用,我在这里总结一下经验分享给大家~ 1.Gromacs安装略应该这个不可以使用mpi版本,自己测试也无法完成,若需要用mpi版本应该需要改bash脚本,至少将gromacs命令相应更改(PS:我使... Continue reading...

1.先多模版比对123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839# Illustrates the SALIGN multiple structure/sequence alignmentfrom modeller import *log.verbose()env = environ()env.io.a... Continue reading...