[转]pymol小技巧-选择配体周围氨基酸残基

我们常常遇到想要选取配体周围几埃范围内的氨基酸，这样更有利于我们分析配体和周围氨基酸的作用。
首先我们可以通过命令

#ligand为选择配体的名字
select ligand，resn x
#设置为红色
color red， ligand
#配体5埃范围内的残基
select 5A， byres ligand around 5
show sticks, 5A
color yellow, 5A

转载自：pymol使用小技巧8-选取配体周围氨基酸