由于gromacs，amber等都需要CUDA的安装，所以我们将其额外的提出来讲解其安装

点击下载：CUDA驱动

我的选择如下：

第一个和第二个为本地安装，第三个为在线安装

深度截图20151203002727
深度截图20151203002727

之后按照如下提示即可：

1.进入下载的目录，本人的为（/home/kangsgo/mdinstall/）

1
cd /home/kangsgo/mdinstall

2.直接按照底部说的安装

1
2
3
sudo dpkg -i cuda-repo-ubuntu1404_7.5-18_amd64.deb
sudo apt-get update
sudo apt-get install cuda

3.设置环境变量

1
2
3
4
5
6
7
8
9
gedit(或者vi进入文本编辑模式) ~/.zshrc   (ubuntu客户端为bashrc，后面都需要修改，下同)
# CUDA
export PATH=”$PATH:/usr/local/cuda-7.5/bin”
export LD_LIBRARY_PATH=”$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/cuda-7.5/lib64“
具体目录需要自己进入usr/local/ 查看
source  ~/.zshrc

到此结束

倘若你下载的为run编译包，我试了，但是有一点问题，建议在线安装

Run编译包安装如下：

1.建立连接（个人测试这个并没有用）：

1
sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libGLU.so.1.3.1 /usr/lib/libGLU.so

2.切换至tty1

Ctrl+Alt+F1

倘若出现黑屏按照此文进行修改：点击进入

3.关闭X-windows

1
sudo service lightdm stop

4.赋权：

1
sudo sh cuda-7.5.18-linux.run

5.安装

一路accept-yes-yes-default等待默认即可

6.重新启动X-Window：

1
sudo service lightdm start

7.环境变量设置

1
2
3
4
5
6
7
~/.zshrc
export PATH=/usr/local/cuda-7.5/bin:$PATH’
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-7.5/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
source  ~/.zshrc

本人完成后sample会有报错，暂未发现影响和解决办法

参考文章：Caffe + Ubuntu 14.04 64bit + CUDA 6.5 配置说明