Normal Mode Wizard
Normal Mode Wizard (NMWiz)是一个VMD插件用来设计作为可视化的比较分析正常模式的数据,例如:模型能够来源于主成分,本质动力学,正常模型分析或者描述任何分子的矢量运动
功能
- NMWiz被设计作为ProDy的界面,能够被使用作为:
- 执行ANM,GNM和PCA/EDA计算
- 绘制用户自定义的的豪猪图
- 制作动画效果(简单的构象)
- 制作相互作用平方米波动图
- 比较两个结构并且绘画箭头
下载
NMWiz自VMD v1.91其被剥离。升级VMD到最新版即可使用.check out 获得NMWiz
参考文献:
ProDy: Protein Dynamics Inferred from Theory and Experiments Bakan A, Meireles LM, Bahar I 2011 Bioinformatics 27(11):1575-1577