Evol对于协同进化分析

Evol是一个强大且高效的API工具和应用对于分析序列的进化和比较蛋白质动力学功能/作用。

API功能

确定保守的和共同进化的氨基酸残基

查询蛋白质家族数据库（Pfam）和索取MSA文件

极其快速的MSA IO 功能

非常灵活的MSA类型序列索引

应用

Evol 应用能够允许你分析非常大的MSA文件，保存或者绘画数字结果而不需要编写任何代码。你能够读取输出文件和继续分析使用你喜欢的软件。

参考文献

Sequence Evolution Correlates with Structural Dynamics Liu Y, Bahar I 2012 Mol Biol Evol 29(9):2253-2263
Role of Hsp70 ATPase domain intrinsic dynamics and sequence evolution in enabling its functional interactions with NEFs Liu Y, Gierasch LM, Bahar 2010 PLoS Comput Biol 6(9)